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2013年11月平成25年度理事長賞「遺伝子解析と形質解析を統合したサクラ栽培品種の再分類と系統関係の解明
2013年6月2012年度日本育種学会論文賞「核SSRマーカーによるサクラ栽培品種の識別」
2012年5月第55回林木育種賞「日本産希少トウヒ属樹木の保全に関する研究」
2011年11月平成23年度理事長賞「世界自然遺産小笠原諸島の保全に対する科学的・社会的貢献」
2011年5月第13回森林立地学会誌論文賞「人工林の気象害跡地における微地形に対応した森林群落の再生過程に関する研究」
2010年4月2010年Journal of Forest Research論文賞「間伐と林地生産力が森林成長の減退に与える影響を明らかにした研究」
2009年3月第9回Ecological Research論文賞「オニグルミ種子サイズの地域変異を2種のゲッ歯類の貯食行動によって説明した研究」
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